Disiplin tidak dibentuk melalui ketegasan dan paksaan akan tetapi dibentuk melalui keteladanan dan pembiasaan. Inilah yang sedang diupayakan oleh SMPIT Ibnu Masúd dalam memberikan pelayanan pendidikan yang terbaik. SMPIT Ibnu Mas’ud senantiasa ‘menjalankan program-progamnya. Salah satu diantaranya adalah program peningkatan disiplin siswa melalui kegiatan harian sekolah. Seperti dalam kegiatan pembiasaan pagi harian yaitu sholat dhuha, pengecekan kesiapan siswa sebelum masuk sekolah oleh guru, menyanyikan lagu kebangsaan dan Mars JSIT serta murajaah setiap awal kegiatan pembelajaran.
Kegiatan-kegiatan ini dilaksanakan secara rutin dengan pantauan dari guru. Kegiatan dimulai dari jam 7 tepat dimana siswa dan guru mengawali kegiatan dengan sholat dhuha bersama-sama. Setelah itu, siswa berbaris di depan kelas masing-masing dan dipandu guru untuk menyanyikan lagu kebangsaan dan Mars JSIT. Guru kemudian mengecek kesiapan siswa sebelum mengikuti pembelajaran, mulai dari seragam, kebersihan, kerapian diri, dan cek kesiapan mengikuti pembelajaran. Dengan beberapa pembiasan ini diharapkan sikap disiplin siswa akan terbentuk dengan sendirinya.
